Преподобный Варлаам Хутынский, в миру Алексей Михайлович, жил в XII веке, был сыном знатного новгородца и свои детские годы провел в Новгороде. По кончине родителей, раздав все свое имение бедным, Алексей удалился в подгородний Лисичий монастырь, где и принял иноческий постриг от наставника своего, священноинока Порфирия, и стал носить имя Варлаам. Стал искать Варлаам место для уединенных подвигов, и приглянулся ему на берегу Волхова холм. Согласно народному преданию место это называлось «Хутынь», то есть худое, плохое место, потому что находилось во власти нечистой силы. Увидев луч света, идущий из чащи леса, монах Варлаам решил, что это знамение Божие и именно здесь он должен остаться. Здесь он и соорудил себе келию. В уединении прп. Варлаам проводил суровую жизнь, непрестанно совершая молитвы и соблюдая очень строгий пост. Он ревностно подвизался в трудах – сам рубил лес, пилил дрова, пахал землю, исполняя слова Священного Писания: «Кто не хочет трудиться, тот и не ешь» (2 Фес.3, 10). Скоро распространилась молва о святом отшельнике, и начали приходить к его пустынному жилищу люди всякого звания - просить совета и наставлений. Поучая приходивших, прп. Варлаам говорил: «Чада, блюдитесь от всякой неправды, не завидуйте, не клевещите. Воздерживайтесь от гнева, не отдавайте денег в рост. Берегитесь судить неправо».
Был у преподобного и Новгородский князь Ярослав, которому предсказал Варлаам рождение сына. Когда предсказание сбылось, князь избрал старца восприемником новорожденного (крестным отцем). Мало-помалу пустынь отшельника населилась. Видя умножение братий, преподобный выстроил деревянную церковь во имя Преображения Господня («в память того небесного света, который осенил его здесь») и положил основание Хутынской обители. Святой Варлаам преставился 6/19 ноября 1192 года, избрав перед кончиною преемником своим прп. Антония Дымского. Мощи старца Варлаама, прославленные чудесами, почивают в созданной им обители, в церкви Преображения. Они обретены в первой половине XV столетия. Сей угодник Божий был весьма уважаем Новгородским архиепископом и часто беседовал с ним. Однажды, когда преосвященный, отпуская от себя Варлаама, приглашал его опять к себе, преподобный ответствовал: "Владыко мой святый, аще Бог благословит на первой седмице поста славных и всехвальных Апостол, в день пятничный приеду на санях ко благословению преосвященства твоего". Действительно, в ночь на пяток первой недели Петрова поста выпал снег на полтора аршина и, когда все унывали, опасаясь истребления жатвы, старец Варлаам предсказал напротив того урожай, что и сбылось, ибо снег истребил червя, который во множестве показался на растениях. В память этого события положено совершать ежегодно Крестный Ход из Софийского собора в Хутынский монастырь в первую пятницу поста Верховных Апостол. В житии Варлаама Хутынского описано еще одно чудо, происшедшее при гробе сего святого угодника. В 1462 г., когда по повелению царя Иоанна Грозного, отставив каменную доску от гроба Варлаамова, начали копать землю, вдруг показался дым и пламень. От дыма закоптели стены, а огнем опалило двери. Государь с предстоявшими с ним, устрашаясь, поспешно удалился и бросил там посох свой, который и доныне в монастыре находится. Там же хранится подлинная грамота Варлаамова, его вериги, власяница и существует даже его келия. Служебник, писаный на пергаменте и присланный прп. Варлааму из Царьграда, находился также в монастыре, ныне же хранится он в Московской синодальной ризнице. Монастырь Хутынский был разграблен в начале XVII столетия шведами, но потом возобновлен и украшен вкладами царей и доброхотов.
До закрытия монастыря в 1925 году на его территории богослужение проходило одновременно в пяти церквях. Возрождение святой обители, но уже как женского монастыря, началось в 1994 году. За короткий срок буквально из руин были восстановлены его основные храмы и строения.
Церковь совершает память прп. Варлаама 6/19 ноября, а также: в 1-й пяток Петрова поста; во 2-ю неделю по Пятидесятнице (Всех святых в земле Российской просиявших); в 3-ю неделю по Пятидесятнице (собор Новгородских святых).
